Préparation de librairies ADN
Chaque fragment d'ADN révèle ses secrets par le séquençage
Libérez la puissance des données génomiques
Chez GENXMAP, notre service de préparation de librairies d'ADN est conçu pour maximiser le potentiel de vos projets de recherche en fournissant des échantillons de la plus haute qualité. Grâce à notre expertise, nous adaptons le processus de préparation des librairies en fonction du type d'échantillon et des objectifs spécifiques de votre étude. Que vous ayez besoin d'une couverture ciblée pour des études de séquençage ou d'une approche plus exhaustive, nous garantissons une conversion précise des acides nucléiques en formats compatibles avec les technologies de séquençage les plus avancées. Cette personnalisation assure des résultats fiables et reproductibles, essentiels pour toute analyse génomique.
Notre service est conçu pour optimiser la qualité des données générées, tout en s’adaptant aux besoins spécifiques de chaque client. Nous proposons des solutions personnalisées pour convertir vos échantillons d'ADN en librairies prêtes à être séquencées.
Exemple des préparations de librairies proposées par GENXMAP et leurs applications :
Expertise en Préparation de Librairies sur Mesure
Préparez vos échantillons de manière optimale pour obtenir des résultats précis. Fiabilité et précision garanties.
Préparation de librairies ADN
Préparation de librairies de séquençage hautement optimisée, incluant l'insertion de tags d'index pour une identification unique des échantillons et une gestion efficace des multiplexages, adaptée aux technologies WGS, WES, ciblé et métagénomique.
Applications :
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Identification et quantification des variations génétiques (SNP, CNV)
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Profilage du microbiome avec identification des espèces
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Détection de mutations et de biomarqueurs
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Études d’expression génique et de régulation.
Détail du Service
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Identification des objectifs (analyse globale, ciblée, validation clinique, etc.).
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Type d’échantillons : Nature, nombre, état et disponibilité des échantillons (ADN purifié, cellules, tissus, etc.).
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Technologies envisagées : Conseils sur la plateforme (Illumina, PacBio, Oxford Nanopore, Sanger, etc.).
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Sélection du type de séquençage :
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WGS (Whole Genome Sequencing).
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WES (Whole Exome Sequencing).
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RNA-seq (profilage transcriptomique).
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Séquençage ciblé ou métagénomique.
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Définition des paramètres :
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Profondeur de séquençage.
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Couverture génomique.
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Multiplexage (si applicable).
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Validation des ressources :
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Évaluation de la qualité et quantité des échantillons disponibles.
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Conseils sur les étapes de préparation en amont : extraction, purification, contrôle qualité.
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Définition du budget :
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Discussion sur un budget fixe ou flexible.
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Établissement du calendrier :
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Estimation des délais pour chaque étape.
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Planification des livrables : données brutes, analyses, rapports.
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À l’issue de cette consultation, vous recevrez :
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Une proposition détaillée : méthodes, technologies, budget et calendrier.
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Une stratégie personnalisée pour maximiser la réussite de votre projet.
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Des conseils clairs pour préparer vos échantillons et optimiser les résultats.
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Librairies génomiques:
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Pour le séquençage complet du génome (Whole Genome Sequencing - WGS).
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Utilisées pour l’analyse globale des variations génomiques (SNP, CNV, etc.).
Librairies ciblées:
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Séquençage de régions spécifiques ou de panels de gènes.
Applications :
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Étude des mutations dans des gènes d’intérêt.
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Validation clinique de variants génétiques.
Librairies métagénomiques:
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Pour l’analyse d’échantillons complexes contenant plusieurs organismes (microbiomes, échantillons environnementaux).
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Compatible avec l’amplification de régions spécifiques (par ex. gène 16S pour les bactéries).
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Étape 0 > Évaluation des échantillons en amont :
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Vérification de la qualité des ADN entrants pour maximiser les chances de succès.
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Rapport envoyé aux clients et décision de "Go / No-Go" pour la poursuite du process
Étape 1 > Fragmentation de l’ADN
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L’ADN est fragmenté à une taille précise pour s’adapter aux exigences de la plateforme de séquençage.
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Méthodes utilisées :
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Fragmentation enzymatique.
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Fragmentation mécanique (par ex. sonication).
Étape 2 > Réparation des extrémités et ajout d’adaptateurs
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Modification des fragments d’ADN pour créer des extrémités adaptées.
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Ajout d’adaptateurs spécifiques permettant la reconnaissance des fragments par la machine de séquençage.
Options disponibles :
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Adaptateurs universels ou spécifiques à un projet.
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Codes-barres (index) pour multiplexage de plusieurs échantillons sur une même piste de séquençage.
Étape 3 > Enrichissement et amplification
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Amplification par PCR pour enrichir les fragments d’intérêt.
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Validation des fragments amplifiés pour garantir l’uniformité.
Étape 4 > Contrôle qualité des librairies
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Analyse de la taille des fragments (par ex. Bioanalyzer, TapeStation).
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Quantification précise (Qubit, qPCR).
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Vérification de la pureté et de l’absence de contamination.
Étape 5 > Livraison des librairies
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Librairie ADN prête à être séquencée.
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Rapport de contrôle qualité incluant :
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Taille des fragments.
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Quantité totale de librairie.
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Résultats des analyses de pureté.
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Optimisation des protocoles : GENXMAP ajuste les protocoles en fonction des contraintes du projet (quantité limitée d’ADN, qualité dégradée, etc.).
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Design de librairies personnalisées :
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Adaptateurs spécifiques.
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Indexation pour séquençage multiplexé.
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Préparation de librairies à faible entrée : Protocoles adaptés aux échantillons avec une quantité d’ADN limitée.
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Librairies pour ADN dégradé : Solutions optimisées pour les échantillons FFPE ou anciens (paléogénétique).
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Préparation automatisée : Réduction des risques de variabilité pour les projets à grande échelle.
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Préparation Fast : Idéale pour les projets ayant des contraintes temporelles strictes.
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Réduction des délais > 3 à 5 jours ouvrés (selon la complexité du projet)
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Support prioritaire
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Optimisation des processus
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Options
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Sélectionnez
Nos processus Go/No-Go vous permettent de suivre l'avancement de votre projet en temps réel. À chaque étape, vous validez le passage à la suivante, assurant un contrôle total et garantissant une transparence maximale tout au long du processus.
Nos délais optimisés garantissent une exécution rapide et efficace de chaque projet, tout en respectant vos exigences spécifiques. Ce système assure une gestion proactive du temps, minimisant les retards et maximisant la productivité pour obtenir des résultats conformes à vos attentes.
Nos processus sur mesure sont conçus pour répondre aux besoins uniques de chaque projet, offrant flexibilité et suivi personnalisé. Ce système garantit un contrôle rigoureux tout en assurant des résultats précis et en adéquation avec vos attentes.
Nos analyses détaillées garantissent des résultats fiables et approfondis, adaptés à chaque étude. Grâce à des outils de pointe et des méthodologies éprouvées, nous offrons une compréhension précise des données génétiques, tout en respectant les plus hauts standards de qualité et de rigueur scientifique.
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