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Séquençage de l'ADN

Décryptage de l’information génétique

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Accélérez la découverte de biomarqueurs avec GENXMAP

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Nous vous proposons une gamme complète de services de séquençage conçus pour répondre aux besoins spécifiques de vos projets de recherche, cliniques ou industriels. Nous mettons à votre disposition les dernières technologies, comme le Séquençage Sanger, NovaSeq 6000, MiSeq, MGI et Oxford Nanopore (ONT), pour garantir des résultats rapides, précis et adaptés à vos objectifs.

 

Que vous exploriez des mutations génétiques, des variants rares ou que vous ayez besoin d'une analyse de génome complet, nous avons les outils et l'expertise pour vous accompagner à chaque étape. Choisir GENXMAP, c’est opter pour un partenaire qui s'engage à maximiser l'efficacité et la qualité de vos analyses génomiques. Nos experts travaillent en étroite collaboration avec vous pour personnaliser chaque approche, vous assurant ainsi des solutions sur mesure, parfaitement alignées sur les spécificités de votre projet. En intégrant précision, rapidité et flexibilité, nous vous permettons de transformer vos données en découvertes impactantes. Faites confiance à GENXMAP pour avancer dans vos recherches avec la certitude d’obtenir des résultats fiables et exploitables.

High-Precision DNA Sequencing

Technologies et méthodes disponibles:

  • Séquençage Sanger

  • ​Technologie Oxford Nanopore (ONT)

  • Technologies MGI

  • Technologies Illumina

>98%

Précision de séquençage

300 Gb

Volume de données générées

10j

Délais moyen de livraison des résultats

Pourquoi Choisir GENXMAP ?
✅ Expertise reconnue en génomique et transcriptomique
✅ Solutions adaptées aux besoins académiques et industriels
✅ Accompagnement personnalisé et support bioinformatique
✅ Technologies de pointe et analyses rigoureuses

Séquençage Avancé, Solutions Sur Mesure

Nos services de séquençage sont entièrement personnalisables pour s’adapter à vos besoins spécifiques, garantissant des résultats précis et optimisés pour chaque projet.

NovaSeq6000

La technologie Illumina repose sur le séquençage à haut débit, utilisant des réactions de synthèse d'ADN pour lire simultanément des millions de fragments. Chaque fragment d'ADN est immobilisé sur une surface, où des nucléotides fluorescents sont ajoutés un par un. Les signaux lumineux générés à chaque ajout permettent de déterminer avec précision la séquence de l'ADN.

Notre service NovaSeq 6000 permet le séquençage à grande échelle pour les projets génomiques les plus complexes, offrant une capacité de traitement inégalée.

Avantages :

  • Évolutivité : Jusqu'à 6 térabases par run.

  • Flexibilité : Options de flow cells pour personnaliser chaque projet.

  • Rentabilité : Optimisé pour les études à grande échelle.

Applications :

  • Séquençage de génome entier (WGS)

  • Séquençage d'exome

  • Transcriptomique à grande échelle (scRNA-Seq)

MiSeq

La technologie Illumina repose sur le séquençage à haut débit, utilisant des réactions de synthèse d'ADN pour lire simultanément des millions de fragments. Chaque fragment d'ADN est immobilisé sur une surface, où des nucléotides fluorescents sont ajoutés un par un. Les signaux lumineux générés à chaque ajout permettent de déterminer avec précision la séquence de l'ADN.

​Notre MiSeq est idéal pour les projets de plus petite échelle nécessitant rapidité et précision, en particulier pour le séquençage ciblé.

Avantages :

  • Rapidité d'exécution : Résultats accélérés pour les projets urgents.

  • Polyvalence : Adapté au séquençage ciblé ou aux petits génomes.

  • Haute qualité : Données fiables pour les applications cliniques.

Applications :

  • Panels génétiques ciblés

  • Métagénomique (analyse 16S rRNA)

  • Séquençage de petits génomes (virus, bactéries)

Technologies MGI

Les systèmes de séquençage MGI utilisent une technologie de séquençage à haut débit pour lire efficacement de grandes quantités d'ADN. Ils sont appliqués au séquençage de génome entier, au séquençage ciblé, à la transcriptomique et à l'analyse du microbiome. Ces systèmes sont essentiels pour la recherche biomédicale, le diagnostic clinique et l'étude des maladies génétiques.

Oxford Nanopore Technology (ONT)

Avec des lectures longues et une analyse en temps réel, la technologie ONT est idéale pour explorer les régions génomiques complexes et réaliser du séquençage sur site.

Avantages :

  • Lectures longues (>100 000 paires de bases)

  • Données en temps réel

  • Portabilité pour le séquençage sur site

  • Séquençage direct de l'ARN sans conversion

Applications :

  • Détection des variants structurels

  • Transcriptomique en pleine longueur

  • Assemblage de novo

  • Séquençage sur site

Sanger Sequencing

Le séquençage Sanger reste la référence pour les projets nécessitant une précision maximale, notamment pour la validation de mutations.

Avantages :

  • Haute précision

  • Lectures jusqu'à 1 000 paires de bases

  • Idéal pour le séquençage ciblé

Applications :

  • Détection de mutations (SNPs)

  • Validation des résultats de NGS

  • Séquençage de gènes spécifiques

Details du Service

    • Etude de projet :

      • Identification des buts scientifiques ou cliniques (par ex. analyse de mutations, étude de l’expression génique, séquençage de génomes entiers).

      • Définition des attentes en termes de précision, profondeur de séquençage et délai.

     

    • Choix des technologies :

      • Discussion sur les plateformes de séquençage disponibles (Sanger, NGS, etc.).

      • Sélection du type de séquençage adapté (génome, exome, ciblé, RNA-seq, etc.).

     

    • Analyse des échantillons :

      • Évaluation du type et de la quantité d’échantillons disponibles (ADN génomique, ARN, tissus, cellules).

      • Vérification de leur qualité et de leur compatibilité avec les techniques de séquençage choisies.

     

    • Planification des étapes du projet :

      • Définition des étapes clés : extraction, préparation des librairies, séquençage, analyse bioinformatique, livraison des résultats.

      • Estimation du délai pour chaque phase.

     

    • Validation du budget :​

      • Points abordés lors de la validation du budget

      • Coût par étape : Extraction, préparation des librairies, séquençage, analyse.

      • Volume d'échantillons : Réduction des coûts possibles pour des lots importants.

      • Technologies : Choix de la méthode la plus adaptée pour combiner performance et rentabilité.

    • Délai : Les projets urgents peuvent engendrer des coûts supplémentaires.

    • Budget fixe:

      • Une fois défini, le budget reste constant pour toutes les étapes.

      • Idéal pour les projets avec des contraintes budgétaires strictes.

      • GENXMAP ajuste le protocole ou les technologies sélectionnées afin de respecter les limites financières.

        • Avantages :

          • Transparence totale : aucun coût additionnel imprévu.

          • Permet de planifier les dépenses en toute confiance.

    • Budget flexible :​

      • Adaptation des coûts en fonction des ajustements nécessaires au projet (quantité d’échantillons, profondeur de séquençage, analyse supplémentaire).

      • Idéal pour des projets complexes ou évolutifs, où des ajustements peuvent survenir après les premières analyses.

        • Avantages :

          • Offre plus de liberté pour explorer des solutions innovantes.

          • Permet d’adapter les services à des découvertes ou besoins imprévus.

    • À l’issue de la consultation initiale, GENXMAP fournit un plan de projet personnalisé détaillant :

      • Les étapes à suivre.

      • Les technologies choisies.

      • Les besoins en échantillons.

      • Le calendrier prévu.

      • Une proposition budgétaire transparente.

      • Des conseils pour optimiser la préparation ou l’envoi des échantillons, si nécessaire.

    • ​Types de séquençage proposés:

    • Séquençage Sanger (classique). ​Méthode traditionnelle pour des séquences courtes (jusqu'à 1 000 pb).

      • Applications :

        • Vérification de mutations ponctuelles.

        • Validation de constructions plasmidiques.

        • Contrôle qualité des séquences clonées.

    • Séquençage de nouvelle génération (NGS) : Analyse à haut débit pour des projets complexes ou volumineux.

      • Technologies utilisées :

        • Illumina pour une grande précision et une couverture élevée.

        • Autres plateformes disponibles en fonction des besoins (ex: Oxford Nanoporetechnology).

      • Applications :

        • Whole Genome Sequencing (WGS) : Séquençage complet de génomes.

        • Whole Exome Sequencing (WES) : Ciblage des régions codantes du génome.

        • Targeted Sequencing : Séquençage ciblé sur des régions spécifiques.

        • Détection de mutations, variations structurales et polymorphismes.

    • Étape 1 > Préparation des échantillons

      • Acceptation de divers types d’échantillons :

      • ADN génomique purifié (idéalement >50 ng/µL).

      • Tissus, cellules, ou fluides biologiques pour extraction par GENXMAP.

      • Contrôle qualité des échantillons :

      • Mesure de la concentration (Qubit, NanoDrop).

      • Évaluation de l’intégrité via électrophorèse ou Bioanalyzer.

    • Étape 2 > Préparation des librairies

      • Adaptation de la préparation en fonction :

      • Du type d’échantillon (ADN génomique, plasmides, PCR, etc.).

      • De l’objectif du projet (ciblage, exome, transcriptome).

      • Options de personnalisation pour des besoins spécifiques.

    • Étape 3 > Séquençage

      • Exécution sur la plateforme sélectionnée (Sanger ou NGS).

      • Ajustement de la profondeur de séquençage pour répondre aux exigences de couverture et de sensibilité.

    • Étape 4 > Analyse bioinformatique

      • Traitement des données brutes :

      • Alignement des lectures sur une référence génomique.

      • Identification des variants génétiques (SNP, CNV, InDel, etc.).

      • ​Assemblage de novo si nécessaire.

      • ​Fourniture de fichiers standards (FASTQ, BAM, VCF) et de rapports personnalisés.​​
         

    • Étape 5 > Livraison des résultats

      • Résultats transmis via un espace sécurisé ou via un disque externe de stockage.

      • Support technique pour interprétation et exploitation des données.

    • Option 1 : Service clé en main >> Idéal pour les clients souhaitant externaliser tout le processus. Prise en charge complète du projet, de la réception des échantillons à la livraison des résultats analysés.

      • Comprend :

        • Extraction et purification des acides nucléiques.

        • Contrôle qualité (Qubit, NanoDrop, Bioanalyzer).

        • Préparation des librairies adaptées au type de séquençage.

        • Séquençage sur plateforme sélectionnée.

        • Analyse bioinformatique complète et rapport interprété.
           

    • Option 2 : Service partiel (à la carte) >> Idéal pour les laboratoires disposant de capacités internes mais nécessitant une expertise pour des étapes spécifiques. Permet aux clients de choisir uniquement certaines étapes du processus.

      • Exemples d’étapes à choisir :

        • Préparation des librairies.

        • Séquençage uniquement (Sanger ou NGS).

        • Analyse bioinformatique avancée (alignement, détection de variants, etc.).
           

    • Option 3 : Séquençage standard >> Idéal pour les clients disposant d'une équipe bioinformatique interne (Fourniture des données brutes sans analyse supplémentaire).

      • Comprend :

        • Séquençage de l'ADN ou ARN purifié.

        • Contrôles qualité de base.

        • Fichiers de sortie (FASTQ, BAM).
           

    • Option 4 : Choix des technologies de séquençage

      • Séquencage Sanger >> Méthode classique, précise et rapide pour des séquences courtes (jusqu'à 1 000 pb).

        • Applications :

          • Vérification de mutations ponctuelles.

          • Validation de constructions plasmidiques.

          • Analyse ciblée.
             

      • Séquençage NGS (Next-Generation Sequencing) >> Analyse à haut débit, adaptée aux projets complexes ou volumineux.

        • Options disponibles :

          • Whole Genome Sequencing (WGS) : Séquençage complet d’un génome.

          • Whole Exome Sequencing (WES) : Séquençage des régions codantes uniquement.

          • Targeted Sequencing : Séquençage de régions génomiques spécifiques.

          • Séquencage personnalis :  Adapté aux projets spécifiques nécessitant un design unique (par ex. métagénomique ou études d’interaction hôte-pathogène).
             

    • Options 5 : Analyse bioinformatique

      • Analyse basique

        • Traitement des données brutes pour fournir :

        • Alignement des lectures.

        • Fichiers FASTQ, BAM ou VCF.

      • Analyse avancée >> Adapté aux exigences réglementaires ou cliniques si nécessaire.

        • Intégration de méthodes bioinformatiques approfondies :

        • Détection des variants (SNP, InDel, CNV).

        • Assemblage de novo.

        • Analyse différentielle (expression génique, RNA-seq).

        • Rapports personnalisés

        • Résultats interprétés avec graphiques et explications détaillées.
           

    • Option 6 : Flexibilité selon le volume et la profondeur

    • Volume d’échantillons : Tarifs dégressifs pour des lots importants.

    • Profondeur de séquençage :

    • Options standard pour des analyses générales.

    • Profondeur élevée pour détecter des mutations rares ou explorer des génomes complexes.

Options

Accédez à nos solutions de séquençage et obtenez des analyses génétiques précises et approfondies.

 GENXMAP, votre partenaire de confiance pour vous soutenir dans vos recherches

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Avantages & Différenciation

Une approche multi-omique complète avec une analyse flexible et des validations rigoureuses, garantissant des biomarqueurs précis et exploitables pour la recherche et la médecine personnalisée.

🔬 Approche Complète & Intégrée

Biomarker Xplorer combine l’ADN, l’ARN et les protéines, offrant une vue holistique des phénomènes biologiques.

🎯 Flexibilité & Modularité

Chaque client peut composer son propre pack d’analyse en fonction de ses besoins spécifiques, allant de la simple extraction à l’analyse avancée et la validation expérimentale.

🧠 Expertise Bioinformatique Avancée

Nos outils d’analyse permettent une détection précise des variations génétiques et des profils d’expression différentiels, avec des annotations fonctionnelles pertinentes.

✅ Validation Expérimentale Rigoureuse

Les biomarqueurs identifiés peuvent être validés par qPCR, dPCR et protéomique, garantissant leur robustesse et leur pertinence clinique.

🚀 Accélération de la Recherche & Applications Cliniques

Notre approche permet de préciser les diagnostics, personnaliser les traitements et optimiser le développement thérapeutique.

Des Services optimisés et transparents

  • Nos processus Go/No-Go vous permettent de suivre l'avancement de votre projet en temps réel. À chaque étape, vous validez le passage à la suivante, assurant un contrôle total et garantissant une transparence maximale tout au long du processus.

  • Nos délais optimisés garantissent une exécution rapide et efficace de chaque projet, tout en respectant vos exigences spécifiques. Ce système assure une gestion proactive du temps, minimisant les retards et maximisant la productivité pour obtenir des résultats conformes à vos attentes.

  • Nos processus sur mesure sont conçus pour répondre aux besoins uniques de chaque projet, offrant flexibilité et suivi personnalisé. Ce système garantit un contrôle rigoureux tout en assurant des résultats précis et en adéquation avec vos attentes.

  • Nos analyses détaillées garantissent des résultats fiables et approfondis, adaptés à chaque étude. Grâce à des outils de pointe et des méthodologies éprouvées, nous offrons une compréhension précise des données génétiques, tout en respectant les plus hauts standards de qualité et de rigueur scientifique.

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Nos autres solutions

Des services précis et avancés, des technologies de pointe et des analyses fiables.
Notre approche rigoureuse permet d’obtenir des résultats détaillés, essentiels pour vos découvertes scientifiques et applications cliniques.

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Précision, innovation et fiabilité au service de vos découvertes.

Découvrez sur notre blog comment nos technologies de pointe et nos analyses avancées ouvrent de nouvelles perspectives en recherche scientifique et applications cliniques.

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