Analyse de la résistance des plantes au stress – Biomarqueurs transcriptomiques

La résistance des plantes au stress est essentielle pour leur survie dans des conditions environnementales difficiles telles que la sécheresse, la salinité, la température extrême, ou l'attaque de pathogènes. L’analyse de l’expression génique permet d'identifier des biomarqueurs associés aux mécanismes de défense des plantes contre ces différents types de stress.

Gènes analysés dans la résistance des plantes au stress

Notre panel cible des biomarqueurs clés impliqués dans la réponse au stress abiotiques et biotiques, notamment :

• DREB1 (Dehydration Responsive Element Binding 1) – Transcriptionnellement activé lors du stress hydrique, ce gène joue un rôle clé dans la réponse des plantes à la sécheresse

• LEA (Late Embryogenesis Abundant Proteins) – Protéines liées à la tolérance à la sécheresse et au stress salin, impliquées dans la protection des cellules végétales en conditions extrêmes

• NPR1 (Nonexpressor of Pathogenesis-Related genes 1) – Gène clé dans la réponse des plantes aux pathogènes, notamment les attaques fongiques et bactériennes

• P5CS (Δ1-Pyrroline-5-Carboxylate Synthase) – Enzyme impliquée dans la synthèse de la proline, un osmoprotecteur qui aide les plantes à résister à la salinité et à la sécheresse

• CYP450 (Cytochrome P450) – Enzyme impliquée dans la biosynthèse de composés de défense et dans la réponse aux stress abiotiques, tels que les UV et les toxines

• HSP70 (Heat Shock Protein 70) – Protéine de choc thermique, qui protège les protéines cellulaires pendant le stress thermique et facilite leur repliement

• RBOH (Respiratory Burst Oxidase Homolog) – Enzyme impliquée dans la production de ROS (espèces réactives de l'oxygène) pendant le stress, qui joue un rôle dans la défense contre les pathogènes

• MAPK (Mitogen-Activated Protein Kinase) – Voie de signalisation impliquée dans la réponse des plantes au stress biotique et abiotique

• Atf (Activation Transcription Factor) – Facteur de transcription impliqué dans la régulation des gènes de défense contre le stress environnemental

• SOD (Superoxide Dismutase) – Enzyme qui réduit les dommages causés par les ROS et protège les cellules végétales contre les stress environnementaux

Applications & Intérêts

• Amélioration des cultures agricoles : L’analyse des biomarqueurs permet de développer des variétés de plantes plus résistantes aux conditions climatiques extrêmes et aux pathogènes

• Optimisation de la gestion de l'irrigation : Identifier les plantes mieux adaptées à des environnements secs et optimiser les stratégies de gestion de l’eau

• Sélection de plantes résistantes au stress : Aider à la sélection génétique de nouvelles plantes ou variétés cultivées qui sont plus résistantes aux stress abiotiques (sécheresse, salinité) et biotiques (insectes, champignons)

• Suivi des changements climatiques : Suivre l'impact du changement climatique sur les plantes en analysant les gènes associés à la résistance au stress

• Protection des cultures contre les maladies et insectes : Améliorer la résistance des cultures aux pathogènes et insectes grâce à une meilleure compréhension des mécanismes biologiques sous-jacents

Technologies utilisées

Nous utilisons des technologies avancées pour une analyse précise des biomarqueurs associés à la résistance des plantes au stress :

• RT-qPCR et PCR digitale (dPCR) pour quantifier l'expression des gènes impliqués dans la réponse au stress

• RNA-seq (NGS) pour une signature transcriptomique globale quantifier l'expression des gènes impliqués dans la réponse au stress

• Technologies multiplexées (ex. Nanostring) pour l’analyse simultanée de biomarqueurs de résistance au stress

• Immunohistochimie pour mesurer l’expression des protéines associées à la défense des plantes

Contactez-nous à contact@genxmap.frpour une analyse personnalisée de la résistance des plantes au stress, afin d’optimiser vos stratégies agricoles et de gestion environnementale !