GENXMAP propose une gamme complète de services de séquençage de pointe, adaptés aux besoins variés de la recherche et des applications cliniques. Nous offrons des solutions de séquençage Sanger pour des études ciblées et de nouvelle génération (NGS) avec des plateformes telles que NovaSeq 6000, MiSeq, MGI et Oxford Nanopore Technologies (ONT). Chaque technologie est optimisée pour des applications spécifiques, allant des projets à grande échelle comme les études de génomique complète aux analyses ciblées comme le séquençage de transcriptome. Ces plateformes offrent une couverture, une profondeur et une précision exceptionnelles, permettant de découvrir des informations génétiques cruciales, qu'il s'agisse de variantes rares ou de profils d'expression génique complexes.
Nous fournissons un accompagnement personnalisé à chaque étape de votre projet. De la définition des objectifs scientifiques à la préparation des échantillons, en passant par l'analyse bioinformatique et l'interprétation des résultats, notre équipe d'experts vous guide pour obtenir des résultats pertinents et exploitables. Nous mettons un accent particulier sur la qualité des données et assurons une communication fluide avec nos clients tout au long du processus, garantissant que vos besoins spécifiques sont toujours pris en compte et que les résultats sont livrés dans les délais impartis.
Pure RNA, Unlocking Precision Analysis
Précision et polyvalence pour toutes les applications
Nous offrons des services de séquençage ARN précis et polyvalents, adaptés à vos besoins spécifiques, en utilisant des technologies avancées pour des solutions rapides, fiables et économiques.
Séquençage Sanger
Le séquençage Sanger offre une précision et une fiabilité de premier ordre, le rendant idéal pour les projets de petite échelle ou les validations critiques.
Avantages :
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Haute précision
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Lectures longues
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Performance optimale pour les projets ciblés
Applications :
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Détection de mutations
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Validation de séquençage
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Séquençage ciblé de gènes
MiSeq
Parfait pour les projets nécessitant des résultats rapides et précis à petite échelle, le MiSeq est idéal pour le séquençage ciblé et les petits génomes.
Avantages :
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Rapidité d’exécution
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Polyvalence pour diverses applications
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Données de haute qualité
Applications :
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Panels de gènes ciblés
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Métagénomique
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Séquençage de petits génomes
NovaSeq 6000
Offrant une puissance inégalée pour les projets génomiques complexes, le NovaSeq 6000 est idéal pour le séquençage à grande échelle et à haute résolution.
Avantages :
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Évolutivité exceptionnelle
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Flexibilité pour divers projets
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Rentabilité pour les analyses de grande envergure
Applications :
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Séquençage de génomes complets
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Séquençage d’exomes
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Transcriptomique à grande échelle, y compris le RNA-Seq en cellule unique
Technologie Oxford Nanopore (ONT)
Le séquençage ONT analyse directement l'ADN et l'ARN natifs, offrant des lectures longues et une détection en temps réel des modifications post-transcriptionnelles.
Avantages :
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Haute précision
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Lectures longues
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Détection des variants d’épissage
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Analyse instantanée
Applications :
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Études de l’ARN natif
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Séquençage de génomes complets
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Recherche biomédicale
Details du Service
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Identification des objectifs de recherche : Vous expliquerez vos objectifs scientifiques, pour comprendre les objectifs de votre étude.
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Identification des types d'échantillons : Vous nous précisez les types d’échantillons que vous souhaitez analyser (selles, sol, eau, tissus, etc.), ce qui nous permet d'adapter le processus de préparation et de séquençage.
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Sélection de la méthodologie : En fonction de vos objectifs, nous vous conseillons sur la méthode la plus appropriée.
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Choix de la plateforme de séquençage : Nous discutons des options disponibles en fonction de la complexité de l'échantillon et du niveau de résolution requis (Illumina, MiSeq, Oxford nanopore technology).
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Estimation du budget et du calendrier
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Validation du budget : Nous vous fournissons une estimation claire du coût du projet en fonction de la méthodologie choisie, du nombre d’échantillons, de la couverture nécessaire et des analyses bioinformatiques supplémentaires.
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Planification temporelle : Une estimation du délai pour la préparation des échantillons, le séquençage, et l’analyse bioinformatique est partagée, avec des points de contrôle réguliers pour suivre l’avancement.
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Suivi et soutien continu
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Accompagnement dans le suivi : Une fois le projet lancé, nous vous accompagnons tout au long du processus, de la récolte des données brutes au soutien bioinformatique pour interpréter les résultats, avec des rapports personnalisés et des recommandations pour les prochaines étapes.
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Séquençage haut débit (Next-Generation Sequencing - NGS). GENXMAP utilise les plateformes suivantes :
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NovaSeq (Illumina)
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Avantages :
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Séquençage rapide et précis de grandes quantités d'ADN provenant de diverses sources environnementales ou biologiques.
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Offre une couverture et une profondeur élevées pour une détection précise des micro-organismes présents.
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MiSeq (Illumina)
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Avantages:
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Haute précision : La technologie de séquençage par synthèse d’Illumina est réputée pour son faible taux d’erreurs, ce qui est idéal pour des analyses nécessitant une grande précision, comme les études de variations génétiques.
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Rapid Turnaround: Quick run times enable timely results for urgent projects.
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Oxford Nanopore technology
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Avantages:
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Longues lectures : ONT permet de générer des lectures très longues (jusqu’à plusieurs centaines de kb), ce qui est précieux pour l’étude des régions complexes du génome, des génomes entiers et des transcrits complets sans fragmentation.
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Real-Time Data: Immediate analysis as sequencing occurs, providing instant insights.
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Étape 0 >> Contrôle de réception des échantillons.
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Evalution visuelle en quantité, qualité
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Rapport et décision client "Go / No-Go" pour la suite du processus
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Étape 1 >> Préparation des échantillons
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Acceptation de divers types d’échantillons :
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ARN purifié (idéalement >50 ng/µL).
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Tissus, cellules, ou fluides biologiques pour extraction par GENXMAP.
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Contrôle qualité des échantillons :
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Mesure de la concentration (Qubit, NanoDrop).
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Évaluation de l’intégrité via électrophorèse ou Bioanalyzer.
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Étape 2 >> Préparation des librairies
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Adaptation de la préparation en fonction :
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Du type d’échantillon (ADN génomique, plasmides, PCR, etc.).
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De l’objectif du projet (ciblage, exome, transcriptome).
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Options de personnalisation pour des besoins spécifiques.
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Étape 3 >> Séquençage
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Exécution sur la plateforme sélectionnée NGS
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Ajustement de la profondeur de séquençage pour répondre aux exigences de couverture et de sensibilité.
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Étape 4 >> Analyse bioinformatique
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Différents types d'analyses sont possibles en fonction du projet (Bulk, scRNAseq ou transcriptomique spatiale)
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Étape 5 >> Livraison des résultats
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Résultats transmis (FASTQ+rapports des analyses bioinformatiques si option choisie) via un espace sécurisé ou via un disque externe de stockage.
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Support technique pour interprétation et exploitation des données.
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Bulk RNA-seq
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scRNA-seq
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Transcriptomique spatiale
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Des Services optimisés et transparents
Nos processus Go/No-Go vous permettent de suivre l'avancement de votre projet en temps réel. À chaque étape, vous validez le passage à la suivante, assurant un contrôle total et garantissant une transparence maximale tout au long du processus.
Nos délais optimisés garantissent une exécution rapide et efficace de chaque projet, tout en respectant vos exigences spécifiques. Ce système assure une gestion proactive du temps, minimisant les retards et maximisant la productivité pour obtenir des résultats conformes à vos attentes.
Nos processus sur mesure sont conçus pour répondre aux besoins uniques de chaque projet, offrant flexibilité et suivi personnalisé. Ce système garantit un contrôle rigoureux tout en assurant des résultats précis et en adéquation avec vos attentes.
Nos analyses détaillées garantissent des résultats fiables et approfondis, adaptés à chaque étude. Grâce à des outils de pointe et des méthodologies éprouvées, nous offrons une compréhension précise des données génétiques, tout en respectant les plus hauts standards de qualité et de rigueur scientifique.
GENXMAP, votre partenaire de confiance pour vous soutenir dans vos recherches
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