GENXMAP se positionne comme un leader dans la fourniture de services d'analyses biostatistiques avancés, visant à extraire des insights précieux de vos données biologiques complexes. Grâce à l'expertise de nos spécialistes, nous utilisons des outils et des méthodes statistiques sophistiqués pour transformer vos données brutes en informations claires et exploitables. Que ce soit à travers des analyses descriptives, inférentielles, multivariées ou longitudinales, nos services sont soigneusement adaptés à vos besoins spécifiques. Nous repoussons sans cesse les frontières des méthodologies statistiques, stimulant ainsi l'innovation dans des domaines variés, allant des essais cliniques au développement de produits cosmétiques, en passant par les études épidémiologiques et les données omiques, telles que la génomique, la transcriptomique et la protéomique.
Grâce à notre approche rigoureuse, associée à la science des données et à l'intelligence artificielle, nous vous aidons à identifier des tendances, à évaluer des associations et à tirer des conclusions robustes. Avec GENXMAP, vous bénéficiez de solutions biostatistiques précises et impactantes qui propulsent vos recherches et développements vers de nouveaux sommets. Faites confiance à notre équipe pour vous accompagner dans l'exploitation optimale de vos données, transformant chaque défi en une opportunité d'innovation et de succès.
Advanced Biostatistical Solutions for Accurate Health Insights
GENXMAP, votre partenaire de confiance pour vous soutenir dans vos recherches
Support biostatistique complet
GENXMAP offre un support complet dans le développement de produits médicaux et l'élargissement des indications thérapeutiques. Notre équipe d'experts en biostatistique garantit une planification et une exécution précises des essais à chaque étape pour atteindre vos objectifs avec succès.
Planification préalable des essais et support de faisabilité
We provide continuous statistical monitoring to ensure data integrity, with adjustments for sample size when necessary. We develop detailed analysis plans to facilitate data interpretation.
Lancement et planification des essais
En collaboration avec nos biostatisticiens, nous garantissons la réussite de la conception des essais en définissant la taille de l'échantillon, les hypothèses, les objectifs et les modèles statistiques. Nous assistons également dans la création de bases de données et l'évaluation des risques.
Support au développement du protocole d'étude
Nous assistons dans la conception de l'essai, le calcul de la taille de l'échantillon, et la définition des hypothèses et des estimations pour améliorer la précision des résultats.
Support continu pour les essais
Nous assurons une surveillance statistique continue pour garantir l'intégrité des données, avec des ajustements de la taille des échantillons lorsque nécessaire. Nous élaborons des plans d'analyse détaillés pour faciliter l'interprétation des données.
Support à l'analyse des essais
Nous réalisons des analyses de données approfondies et préparons des rapports statistiques détaillés. Nos services incluent également des analyses post-hoc pour valider et approfondir les résultats.
Évaluation de nouveaux produits médicaux et cosmétiques
Analyse statistique pour le développement de nouveaux médicaments et produits cosmétiques.
Études épidémiologiques
Support statistique pour les études sur les tendances de santé et les facteurs de risque.
Analyse de données omiques
Analyse avancée des données génomiques, transcriptomiques et protéomiques.
Des Services optimisés et transparents
Nos processus Go/No-Go vous permettent de suivre l'avancement de votre projet en temps réel. À chaque étape, vous validez le passage à la suivante, assurant un contrôle total et garantissant une transparence maximale tout au long du processus.
Nos délais optimisés garantissent une exécution rapide et efficace de chaque projet, tout en respectant vos exigences spécifiques. Ce système assure une gestion proactive du temps, minimisant les retards et maximisant la productivité pour obtenir des résultats conformes à vos attentes.
Nos processus sur mesure sont conçus pour répondre aux besoins uniques de chaque projet, offrant flexibilité et suivi personnalisé. Ce système garantit un contrôle rigoureux tout en assurant des résultats précis et en adéquation avec vos attentes.
Nos analyses détaillées garantissent des résultats fiables et approfondis, adaptés à chaque étude. Grâce à des outils de pointe et des méthodologies éprouvées, nous offrons une compréhension précise des données génétiques, tout en respectant les plus hauts standards de qualité et de rigueur scientifique.
Détails du Service
Consultation initiale
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Identification des objectifs de recherche : Vous expliquerez vos objectifs scientifiques, pour comprendre les objectifs de votre étude, qu'il s'agisse d'analyser la diversité microbiologique, d'identifier des pathogènes ou de caractériser des communautés microbiennes dans un échantillon spécifique.
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Identification des types d'échantillons : Vous nous précisez les types d’échantillons que vous souhaitez analyser (selles, sol, eau, tissus, etc.), ce qui nous permet d'adapter le processus de préparation et de séquençage.
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Sélection de la méthodologie : En fonction de vos objectifs, nous vous conseillons sur la méthode la plus appropriée pour l’analyse métagénomique, telle que le séquençage de gènes spécifiques (par exemple 16S ou 18S rRNA) ou l’approche métagénomique complète (Shotgun).
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Choix de la plateforme de séquençage : Nous discutons des options disponibles en fonction de la complexité de l'échantillon et du niveau de résolution requis (Illumina, MiSeq, Oxford nanopore technology).
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Planification du projet et personnalisation :
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Ciblage spécifique ou séquençage global : Si nécessaire, nous élaborons un panel spécifique pour cibler des gènes ou groupes d'intérêt particuliers, ou optons pour une approche globale pour analyser la diversité génétique dans son ensemble.
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Stratégie d’enrichissement et préparation d’échantillons : Nous définissons les étapes de préparation, incluant la pré-extraction, la purification de l’ADN, et l’enrichissement des régions d’intérêt. Cela est particulièrement important si des populations microbiennes rares ou difficiles à capturer sont présentes.
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Estimation du budget et du calendrier
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Validation du budget : Nous vous fournissons une estimation claire du coût du projet en fonction de la méthodologie choisie, du nombre d’échantillons, de la couverture nécessaire et des analyses bioinformatiques supplémentaires.
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Planification temporelle : Une estimation du délai pour la préparation des échantillons, le séquençage, et l’analyse bioinformatique est partagée, avec des points de contrôle réguliers pour suivre l’avancement.
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Suivi et soutien continu
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Accompagnement dans le suivi : Une fois le projet lancé, nous vous accompagnons tout au long du processus, de la récolte des données brutes au soutien bioinformatique pour interpréter les résultats, avec des rapports personnalisés et des recommandations pour les prochaines étapes.
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Technologies disponibles
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Séquençage haut débit (Next-Generation Sequencing - NGS)
GENXMAP utilise les plateformes suivantes :
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NovaSeq (Illumina)
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Avantages :
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Séquençage rapide et précis de grandes quantités d'ADN provenant de diverses sources environnementales ou biologiques.
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Offre une couverture et une profondeur élevées pour une détection précise des micro-organismes présents.
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MiSeq (Illumina)
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Avantages:
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Haute précision : La technologie de séquençage par synthèse d’Illumina est réputée pour son faible taux d’erreurs, ce qui est idéal pour des analyses nécessitant une grande précision, comme les études de variations génétiques.
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Rapid Turnaround: Quick run times enable timely results for urgent projects.
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Oxford Nanopore technology
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Avantages:
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Longues lectures : ONT permet de générer des lectures très longues (jusqu’à plusieurs centaines de kb), ce qui est précieux pour l’étude des régions complexes du génome, des génomes entiers et des transcrits complets sans fragmentation.
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Real-Time Data: Immediate analysis as sequencing occurs, providing instant insights.
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Process
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Étape 0 : Contrôle de réception des échantillons.
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Evalution visuelle en quantité, qualité
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Rapport et décision client "Go / No-Go" pour la suite du processus
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Étape 1 : Préparation des Échantillons :
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Extraction de l’ADN/ARN : Des protocoles optimisés pour assurer une extraction de haute qualité, même à partir de types d’échantillons difficiles (tissus FFPE, cellules rares, etc.).
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Quantification et évaluation de la qualité : Vérification de la quantité et de la qualité de l’ADN/ARN extrait à l’aide de spectrophotomètres (Nanodrop), Qubit ou fragment analyzer (Qiaxcel).
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Enrichissement ciblé : Si nécessaire, nous appliquons des techniques d’enrichissement pour cibler certaines régions d’intérêt (par exemple, gènes de résistance, gènes 16S rRNA, etc.) avant de passer au séquençage. L’enrichissement permet de concentrer l’analyse sur des zones spécifiques du génome.
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Préparation de la librairie : Une fois l’ADN extrait et éventuellement enrichi, il est fragmenté, puis les adaptateurs nécessaires pour le séquençage sont ajoutés. Ce processus crée une librairie de séquençage prête à être analysée sur la plateforme choisie.
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Étape 2 : Lancement du séquençage : Selon la technologie choisie (Illumina, Oxford Nanopore), nous procédons au séquençage sur la plateforme adaptée.
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Étape 3 : Contrôle qualité en temps réel : Surveillance du processus de séquençage pour garantir l'absence d’erreurs techniques et garantir la qualité des données générées.
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Étape 5 : Analyse des Données :
- Nous proposons différents niveaux d'analyse: primaire, secondaire ou tertiaire en fonction de vos besoins. Nous proposons avec nos partenaire divers types d'analyses telles que:
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Identification taxonomique : Nous utilisons des bases de données comme QIIME, MetaPhlAn, ou Kraken pour identifier les espèces présentes dans l’échantillon et dresser un profil taxonomique détaillé.
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Analyse fonctionnelle : En plus de l'identification taxonomique, nous effectuons une analyse fonctionnelle pour déterminer les gènes et les voies métaboliques présentes dans l'échantillon, notamment les gènes de résistance, les enzymes ou d'autres éléments d'intérêt.
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Assemblage des séquences : Les séquences obtenues sont assemblées et analysées à l’aide de logiciels spécialisés pour reconstruire les génomes des micro-organismes présents dans l’échantillon. Cette étape permet de traiter et de structurer les données brutes.
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- Nous proposons différents niveaux d'analyse: primaire, secondaire ou tertiaire en fonction de vos besoins. Nous proposons avec nos partenaire divers types d'analyses telles que:
Pour en savoir plus, n'hésitez pas à aller vers notre page "Analyses bioinformatique & biostatistique"
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Étape 6 : Validation et Interprétation :
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Interprétation des données : Nos experts bioinformaticiens et nos partenaires analysent les résultats pour vous fournir une interprétation approfondie. Cette analyse permet de mettre en évidence des relations complexes entre les micro-organismes et d'identifier des biomarqueurs ou des cibles thérapeutiques potentielles.
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Rapports détaillés : Un rapport complet et détaillé est généré, incluant des visualisations des résultats (graphes, arbres phylogénétiques, heatmap, etc.), des conclusions sur la diversité microbienne, ainsi que des recommandations pour les étapes suivantes, en fonction des objectifs du projet.
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Étape 7 : Livraison des Résultats :
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Formats de Résultats : Fourniture de fichiers bruts (FASTQ), assemblages, résultats taxonomiques, analyses fonctionnelles et métadonnées.
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Rapport Détaillé : Comprend un résumé des résultats, des visualisations (graphiques, arbres phylogénétiques), une interprétation biologique et des recommandations pour les étapes suivantes.
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Modes de Livraison : Accès via une plateforme en ligne sécurisée, envoi par email ou réunion de présentation des résultats.
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Suivi et Support : Assistance post-livraison pour clarifications, révisions ou analyses complémentaires.
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Délais de Livraison : Généralement entre 3 à 6 semaines, en fonction de la complexité du projet.
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Options
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Séquençage 16S rRNA
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Séquençage 18S rRNA
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Séquençage Shotgun
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Enrichissement des Échantillons
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Avant le séquençage, certaines régions spécifiques du génome peuvent être enrichies (par exemple, les gènes de résistance ou des régions d’intérêt fonctionnel) pour améliorer la couverture de ces régions.
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Support bioinformatique complet
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Confidentialité et conformité
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Suivi complet
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